Muzeum Niepodległości w Warszawie jest użytkownikiem wieczystym gruntów oraz właścicielem budynków, budowli i urządzeń położonych na tych gruntach, dotyczących następujących terenów:
1) działka ew. nr 11 w obrębie 5-02-10 o powierzchni 3494 m
2, położona w Warszawie, przy Al. Solidarności 62 wraz z budynkiem Pałacu Przebendowskich/ Radziwiłłów, dla której prowadzona jest księga wieczysta nr KW 608 –
decyzja Pałac
2) działki ew. nr: 2 w obrębie 7-01-17, nr 15/1, nr 23 i nr 24 w obrębie 7-01-18, o łącznej powierzchni 29 184 m
2, położone w Warszawie, przy ul. Skazańców 25, grunty nie uregulowane w księdze wieczystej po 1945 r. –
decyzja Cytadela
3) działka ew. nr 11 o powierzchni 7366 m
2 w obrębie 5-01-07, położona w Warszawie, przy ul. Dzielnej 24/26, nie uregulowana w księdze wieczystej po 1945 r. –
decyzja Pawiak
Wszystkie budynki stanowiące na mocy w/w decyzji własność Muzeum Nieodległości są obiektami zabytkowymi, wpisanymi do rejestru zabytków nieruchomych przez Miejskiego Konserwatora Zabytków w Warszawie w 1965 r. (
wpis do zabytków Pałac i
wpis do zabytków Cytadela) oraz Wojewódzki Oddział Służby Ochrony Zabytków Województwa Mazowieckiego w 2001 r. (
wpis do zabytków Pawiak). Mauzoleum Walki i Męczeństwa mieszczące się w przedwojennym budynku Ministerstwa Wyznań i Oświecenia Publicznego również jest objęte ochroną konserwatorską (
wpis do zabytków Szucha).
Muzeum, jako samorządowa instytucja kultury, otrzymuje od Organizatora, tj. Zarządu Województwa Mazowieckiego, dotację na działalność statutową. Wysokość dotacji określana jest corocznie przez Organizatora.